L'eupatoire rouge est une plante herbacée vivace, de 1,5 mètre de haut, à racine fibreuse. Sa tige, un peu glauque, se teinte usuellement de pourpre au niveau des noeuds. La plupart des feuilles sont opoosées ou verticillées, lancéolées ou ovales à elliptiques. Brièvement pétiolées, elles possèdent une marge dentée. L'inflorescence composite regroupe de nombreux petits capitules, pauciflores, dont la corolle est d'un rose très pâle ou purpurine.